أوضحت الكونفدرالية الافريقية انه "عقب اختيار المغرب لاستضافة البطولة، قررت لجنة الكاف للطوارىء (...) تأهل مصر لنهائيات البطولة"، بعدما كان منتخب "الفراعنة" قد خسر أمام المنتخب المغربي في تصفيات المنطقة الشمالية للبطولة.
وأوضحت الكونفدرالية الافريقية ان المنتخبات المشاركة ستوزع كالآتي: المنطقة الشمالية (مصر، ليبيا، المغرب)، المنطقة الشرقية (اثيوبيا، أوغندا)، المنطقة الوسطى (الكاميرون، الكونغو، غينيا الاستوائية)، المنطقة الغربية "أ" (غينيا، موريتانيا)، المنطقة الغربية "ب" (بوركينا فاسو، كوت ديفوار، نيجيريا)، المنطقة الجنوبية (أنغولا، ناميبيا، زامبيا).
وكان من المقرر ان يستضيف المغرب نهائيات كأس الامم الافريقية عام 2015، بيد انه رفض تنظيمها بسبب مخاوف مرتبطة بوباء "ايبولا"، فنقلت الى غينيا الاستوائية.