بالنظر إلى أن الفريق الوطني تأهل لمونديال 1986، فإن قرعة تصفيات كأس العالم 1990 التي جرت نهائياتها بإيطاليا ستعفيه من إجراء الدور الأول، ليتأهل مباشرة للدور الثاني الذي أجري بنظام المجموعات (4 مجموعات)، ووضعت القرعة الفريق الوطني الذي كان يقوده وقتذاك المدرب الإيطالي أونطونيو أونجيليلو في المجموعة الرابعة إلى جانب منتخبات: زامبيا، الزايير وتونس.
وافتتح المنتخب المغربي مشوار التصفيات على نحو جيد، عندما واجه يوم 8 يناير 1989 المنتخب الزامبي وفاز عليه بهدف عبد الفتاح الغياثي، إلا أنه سيسقط بعد ذلك في الديربي المغاربي بملعب المنزه أمام المنتخب التونسي بهدفين لهدف واحد، برغم أن الأسود هم من تقدموا بالتسجيل بواسطة عزيز بودربالة.
خسارة أمام تونس أعقبتها نتائج سلبية، إذ تعادل الأسود بكينشاسا أمام الزايير بلا أهداف، وخسروا بلوساكا أمام منتخب زامبيا ثم تعادلوا في آخر مباراتين أمام تونس والزايير، ليتذيل أسود الأطلس المجموعة الرابعة بـ 5 نقاط من فوز و3تعادلات وهزيمتين، ليتأهل عن هذه المجموعة منتخب تونس الذي سيفشل خلال الدور الثالث في بلوغ نهائيات كأس العالم 1990 بخسارته أمام المنتخب الكامروني.
مباريات الأسود في تصفيات مونديال 1990
• الدور الثاني
(نظام المجموعة)
• المغرب ـ زامبيا: 1 ـ 0
هدف المغرب: الغياثي (د4)
• تونس ـ المغرب: 2 ـ 1
هدف المغرب: بودربالة (د4)
• الزايير ـ المغرب: 0 ـ 0
• زامبيا ـ المغرب: 2 ـ 1
هدف المغرب: التيمومي (د73)
• المغرب ـ تونس: 0 ـ 0
• المغرب ـ الزايير: 1 ـ 1
هدف المغرب: محمد مديح (د58)
المغرب يحتل المركز الرابع في المجموعة بـ 5 نقاط مبتعدا بنقطتين عن المتصدر والمتأهل للدور الأخير منتخب تونس.
